Trabajamos en virus respiratorios, principalmente como el virus sincicial respiratorio (RSV, principal causante de la bronquiolitis) o SARS-CoV-2 (COVID-19). Estudiamos sus componentes a nivel molecular y su rol patofisiológico. Nuestro objetivo es comprender los mecanismos involucrados en inmunomodulación e inmunoevasión, para desarrollar estrategias preventivas efectivas.
A través del diseño racional y la ingeniería de proteínas, desarrollamos plataformas autoensamblantes que pueden emplearse para la generación de nanobiodispositivos de próxima generación bajo demanda. Más aún, aprovechamos estas plataformas para la generación de vacunas de próxima generación y herramientas biotecnológicas con aplicaciones en enzimología y diagnóstico.
Integrantes
Damian Alvarez Paggi (Director) con links LinkedIn, Google Scholar y ResearchGate
Sebastián Esperante (Investigador Asociado)
Carla Goldin (Becaria doctoral)
Juan Gutman (Becario doctoral)
Analía Boudgouste (Becaria doctoral)
Julián Grossi (Becario Doctoral)
Victoria Emina (Becaria Doctoral)
Lautaro Ruggieri (Pasante)
Colaboraciones
Gabriela Fernandez, Laboratorio de Fisiología de los Procesos Inflamatorios
Mauricio Caballero, Molecular Pathology and Epidemiolog/ Centro Infant de Medicina
Traslacional
Salvador Ventura, Instituto de Plegamiento de Proteínas y Enfermedades Conformacionales
Pablo Irusta, School of Health, Georgetown University
Hugo Menzella, Instituto de Procesos Biotecnológicos y Químicos, UNR
Daniel Murgida, Laboratorio de Biofisicoquímica de Proteínas Instituto de Química Física de
los Materiales, Medioambiente y Energía [INQUIMAE]
Virginia Tribulatti, Instituto de Investigaciones Biotecnológicas, UNSAM
Publicaciones
https://academic.oup.com/jid/article/228/3/245/7086592?login=false
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0003986122003095
https://www.science.org/doi/full/10.1126/scitranslmed.abj7843
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/nejmoa2033700
https://link.springer.com/article/10.1186/s41231-020-00067-w
Quienes nos apoyan
CONICET
Agencia Nacional de Promoción de la Investigación, el Desarrollo Tecnológico y la Innovacion
Fundación Florencio Fiorini
Academia Nacional de Medicina
Fundación INFANT
Contacto
Twitter @LabNBI
Instagram: @labnbi
Este proyecto apunta a establecer las bases estructurales que rigen el evento de transducción de la señal lumínica en este tipo de fotorreceptores. A su vez, desarrollar herramientas optogenéticas basada en sus estructuras con potencial uso biotecnológico y clínico. Este proyecto es en estrecha colaboración con los Dres. J. Rinaldi y F. Goldbaum (Instituto Leloir-Argentina), H. Bonomi (Université de Montpellier-Francia) y M. Garcia Alai (European Molecular Biology Laboratory EMBL-Alemania).
Este proyecto tiene como objetivo el diseño y caracterización estructural y funcional de nanobodies fotomodulables con potencial uso biotecnológico. En colaboración con las Dras. V. Alzogaray (Pasteur Institute-Francia), D. Albanesi (Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario IBR- Argentina) y J. Rinaldi (Instituto Leloir-Argentina).
En este proyecto específicamente nos focalizamos en el estudio estructural de los complejos formados entre anticuerpos neutralizantes diseñados por la empresa Inmunova SA y los antígenos blanco respectivos. Estos estudios permiten obtener información precisa sobre la interacción antígeno:anticuerpo en la cual se fundamentan estos agentes terapéuticos, como así también realizar un extensivo mapeo de epitopes para la mejora de los productos. Este proyecto es colaboración con la empresa Inmunova SA (Argentina) y el Dr. M. Borgnia (Molecular Microscopy Consortium NIEHS/NIH-EEUU).
Este proyecto es un proyecto interdisciplinario que se encuentra en la frontera entre la Química y la Biología estructural, cuyo objetivo no sólo se limita a la obtención de una familia de glicomiméticos, sino que se extiende al estudio de su actividad biológica y a la comprensión a nivel atómico de los contactos en los que se basa dicha actividad. Este proyecto es en colaboración con los Dres. ML. Uhrig (Centro de Investigación en Hidratos de Carbono CIHIDECAR-Argentina) y A. Cagnoni (Instituto de Biología y Medicina Experimental IBYME-Argentina).
Este proyecto tiene como objetivo una mejor comprensión de la evolución de proteínas de moluscos, sus implicaciones fisiológicas y posibles aplicaciones biomédicas. Este proyecto es en colaboración con los Dres. H. Heras y M. Dreon (Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Profesor Doctor Rodolfo R. Brenner" INIBIOLP-Argentina).
Este proyecto tiene como objetivo la caracterización estructural de proteínas quiméricas diseñadas por la empresa Eureka NBE las cuales se pueden utilizar como andamios fusionados a diferentes “cargoes” para una alta variedad de aplicaciones biotecnológicas. Este proyecto es en colaboración con los Dres. D. Álvarez Paggi (Centro de Re-diseño e Ingeniería de Proteínas CRIP-Argentina) y D. Murgida (Instituto de Química, Física de los Materiales, Medio Ambiente y Energía INQUIMAE, Argentina) y la empresa EUREKA NBE (Argentina).
En este proyecto proponemos evaluar la ocurrencia de eventos de desamidación de residuos de asparragina en la proteína Spike del virus SARS-CoV-2, una reacción espontánea que finalmente conduce a la aparición de residuos aspártico e isoaspártico, que afectan tanto a la carga como a la estructura de la proteína. Estos estudios proporcionan un mecanismo molecular para el envejecimiento con importantes consecuencias para la comprensión de la infectividad del virus y el desarrollo de vacunas. Este proyecto es en colaboración con los Dres. L. Alonso (Instituto de Nanobiotecnología NANOBIOTEC-Argentina), M. Borgnia (Molecular Microscopy Consortium NIEHS/NIH-EEUU) y M. Garcia Alai (European Molecular Biology Laboratory EMBL-Alemania).
Integrantes
Dr. Lisandro H. Otero
Investigador Adjunto CONICET
https://scholar.google.com/citations?user=fj9vViwAAAAJ&hl=en
https://www.researchgate.net/profile/Lisandro-Otero
https://orcid.org/0000-0002-5448-5483
Dra. Sabrina Foscaldi
Becaria posdoctoral Agencia I+D+i
Colaboraciones
María García Alai (European Molecular Biology Laboratory-Hamburg, Germany) https://www.embl.org/groups/garcia-alai/
Mario Borgnia (Genomic Integrity & Structural Biology Laboratory-Durham, EEUU)
https://tools.niehs.nih.gov/staff/index.cfm/main/details/id/0010973781
José-María Carazo (Centro Nacional de Biotecnología- Madrid, Spain) http://i2pc.es/carazo/
Horacio Heras (Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Prof. Dr. Rodolfo R. Brenner"- La Plata, Argentina).
Ricardo Biondi (Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires – Instituto Partner de la Sociedad Max Planck – Buenos Aires, Argentina).
https://ibioba-mpsp-conicet.gov.ar/index.php/es/cv-dr-ricardo-biondi/
Inmunova SA (Buenos Aires, Argentina). https://inmunova.com/
Eureka Nanobioengineering (Buenos Aires, Argentina). https://eurekanbe.tech/
Ceres Demeter SA (Río Cuarto, Argentina) https://ceresdemeter.com.ar/
Publicaciones
1- Exaptation of two ancient immune proteins into a new dimeric pore-forming toxin in snails. Giglio, ML; Ituarte, S; Milesi, V; Dreon, MS; Brola, TR; Caramelo, JJ; Ip, JCH; Maté, S; Qiu, JW; Otero, LH *; Heras, H *. Journal of Structural Biology (2020) 2011: 107531. Artículo seleccionado tapa de revista. * Corresponding author. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32446810/
2- Development of a hyperimmune equine serum therapy for COVID-19 in Argentina. Zylberman, V; Sanguineti, S; Pontoriero, AV; Higa, SV; Cerutti, ML; Morrone Seijo, SM; Muñoz, L; Acuña Intrieri, ME; Alzogaray, VA; Avaro, MM; Benedetti, E; Berguer, PM; Bocanera, L; Bukata, L; Bustelo, MS; Campos, AM, Colonna, M; Correa, E; Cragnaz, L; Dattero, ME; Dellafiore, M; Foscaldi, S; González, JV; Guerra, LI; Klinke, S; Labanda, MS; Lauché, C; López, JC; Martínez, AM; Otero, LH et al. Medicina (Buenos Aires) (2020) 80 (Supl. III): 1-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32658841/
3- Crystal structures of peanut lectin in the presence of synthetic β-N- and β-S-galactosides disclose evidences for the recognition of different glycomimetic ligands. Cagnoni, AJ; Primo, ED; Klinke, S; Cano, ME; Giordano, W; Mariño, KV; Kovensky, J; Goldbaum, FA; Uhrig, ML; Otero, LH *. Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography (2020) D76: 1080-1091. * Corresponding author. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33135679/
4- Dimer asymmetry and light activation mechanism in Brucella blue-light sensor histidine kinase. Rinaldi, J; Fernández, I; Shin, S; Sycz, G; Gunawardana, S; Kumarapperuma, I; Paz, J; Otero, LH; Cerutti, ML; Zorreguieta, A; Ren, Z; Klinke, S; Yang, X; Goldbaum, FA. mBio (2021) 12:e00264-21. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33879593/
5- Pr-favoured variants of the bacteriophytochrome from the plant pathogen Xanthomonas campestris hint on light regulation of virulence-associated mechanisms. Conforte, V *; Otero, LH *; Toum, L; Sirigu, S; Antelo, GT; Rinaldi, J; Klinke, S; Chavas, L; Vojnov, AA; Goldbaum, FA; Malamud, F; Bonomi HR. FEBS Journal (2021) 288: 5986-6002.* Equally contributed to this work. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33864705/
6- Deamidation drives molecular aging of the SARS-CoV-2 spike protein receptor-binding motif. Lorenzo, R; Defelipe, LA; Aliperti, L; Niebling, S; Custódio, TF; Löw, C; Schwarz, JJ; Remans, K; Craig, PO, Otero, LH; Klinke, S; García-Alai, M; Sánchez, IE; Alonso, LG. Journal of Biological Chemistry (2021) 297: 101175. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34499924/
7- Structural basis for the Pr-Pfr long-range signaling mechanism of a full-length bacterial phytochrome at the atomic level. Otero, LH *; Foscaldi, S; Antelo, GT; Rosano, GL; Sirigu, S; Klinke, S; Defelipe, LA; Sánchez-Lamas, M; Battocchio, G; Conforte, V; Vojnov, AA; Chavas, L; Goldbaum, FA; Mroginski, MA; Rinaldi, J *, Bonomi, HR *. Science Advances (2021) 7:eabh1097. * Corresponding author. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34818032/
8- A disordered region holds the full protease inhibitor and adjuvant activities of U-Omp19. Darriba, ML; Pueblas Castro C; Coria, LM; Bruno, L; Cerutti, ML; Otero, LH; Chemes, LB; Rasia, RM; Klinke, S; Cassataro, J; Pasquevich, KA. Computational and Structural Biotechnology Journal (2022) 20: 5098-5114. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36187929/
9- A fijivirus major viroplasm protein shows RNA-stimulated ATPase activity by adopting pentameric and hexameric assemblies of dimers. Llauger, G; Melero, R; Monti, D; Sycz, G; Huck-Iriart, C; Cerutti, ML; Klinke, S; Mikkelsen, E; Tijman, A; Arranz, R; Alfonso, V; Arellano, SM; Goldbaum, FA; Sterckx, YGJ; Carazo, JM; Kaufman, SB; Dans, PD; del Vas, M; Otero, LH *. mBio (2023) 14(2):e0002323.* Corresponding author. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36786587/
10- Cross-protection and cross-neutralization capacity of ancestral and VOC-matched SARS-CoV-2 adenoviral vector-based vaccines. Vinzón, S; López, MV; Cafferata, E; Soto, A; Berguer, P; Vazquez, L; Nusblat, L, Pontoriero, A; Belotti, E; Salvetti, N; Vilardo, A; Avaro, M; Benedetti, E; Russo, M; Dattero, M; Carobene, M; Sánchez-Lamas, M; Afonso, J; Heitrich, M; Cristófalo, A; Otero, LH; Baumeister, E; Ortega, H; Edelstein, A; Podhajcer, O. NPJ Vaccines (2023) 8(1):149. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37794010/
Quienes nos apoyan
CONICET
Agencia I+D+i
Alexander von Humboldt Foundation
Contacto
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@LisandroHOtero1
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https://ar.linkedin.com/in/sabrina-andrea-foscaldi-a874b179
El objetivo del proyecto era lograr una mejora en la viabilidad, densidad celular y/o productividad del bioproceso de un anticuerpo monoclonal biosimilar desarrollado por la empresa. Para ello, a través de diferentes metodologías analíticas, tratamos de identificar y cuantificar nutrientes y metabolitos claves y establecer sus concentraciones óptimas para introducir mejoras racionales en el bioproceso. Este proyecto es desarrollado en alianza con la empresa biofarmacéutica mAbxience.
A diferencia de los test serológicos “comunes”, que evalúan la respuesta total de anticuerpos contra el virus, aquí abordamos el desarrollo de un ensayo serológico en formato ELISA que detecte en forma específica el subgrupo de anticuerpos que presenten capacidad neutralizante, es decir, aquellos que impedir la infección. Este tipo de ensayos de neutralización “sustitutos” ya han sido desarrollados y validados exitosamente en el exterior, demostrando una excelente correlación con los ensayos de seroneutralización tradicionales con partículas virales. A diferencia de estos últimos, nuestro ensayo de no requiere personal altamente calificado ni equipamiento sofisticado, y puede ser completado en tan sólo 4 h, convirtiéndolo en una herramienta sumamente útil para el tamizaje de grandes poblaciones en centros de salud o bien utilizado como método de rutina para el análisis de la eficacia de candidatos terapéuticos o vacunales con bajos costos operativo y alta rapidez. Este proyecto es desarrollado en alianza con la empresa de diagnóstico Chemtest.
Los anticuerpos constituyen las herramientas biológicas más utilizadas en las ciencias de la vida, conformando el segmento de reactivos biológicos de mayor demanda a nivel mundial, tanto en el campo de la investigación y el diagnóstico. Hoy en día, la gran mayoría de los anticuerpos utilizados como reactivos de investigación o diagnóstico pertenecen al grupo de los denominados anticuerpos monoclonales (mAbs), producidos por la tecnología de hibridomas desarrollada por Milstein. Sin embargo, estas líneas celulares son genéticamente inestables, presentando serias limitaciones como fuente de obtención de productos de calidad industrial. Una alternativa superadora lo constituyen los anticuerpos recombinantes (rAbs), los cuales son producidos por la tecnología de ADN recombinante por medio de bioprocesos robustos y escalables. El proyecto contempla tanto la conversión a formato recombinante de mAbs ya desarrollados como el diseño y caracterización de rAbs de interés biomédico y biotenológico.
Integrantes
Dra. María Laura Cerutti, Inv. Adjunta de CONICET y Profesora Adjunta Ad-honorem de EByN-UNSAM. linkedin.com/in/maría-laura-cerutti-5b831531
Miembros actuales
- María Eugenia Acuña Intrieri, becaria doctoral CONICET (2018- presente). linkedin.com/in/maría-eugenia-acuña-intrieri-714670161
Miembros anteriores
- Carolina Miller Flores (tesinista y becaria CIN. 2019 - 2021).
- Miguel Angel Deriane (tesinista, becario CIN. 2021 - 2022).
- Dan Alejandro Perez, (tesinista, becario CIC (2021-2023)
Colaboraciones
Dr. Diego Comerci, Inv. Principal IIBIO-CONICET-UNSAM
Dr. Lisandro Otero, Inv. Independiente INBIAS – CONICET, CRIP-UNSAM
Dr. Sebastián Klinke, Inv. Independiente FIL-IIBBA-CONICET
Dra. Eleonora Campos, Inv. Independiente IABIMO-CONICET-INTA
Dra. Mariana Del Vals, Inv. Independiente IABIMO-CONICET-INTA
Dr. Martín Arán, Inv. Independiente FIL-IIBBA-CONICET
Dr. Germán Rosano, Inv. Adjunto IBR-CONICET
Dra. Mariana Ferrero, Inv. Adjunta IDEHU- CONICET-UBA
Dr. Diego Alvarez, Inv. Independiente IIBIO-CONICET-UNSAM
Dra. Carolina Bluguerman, Inv. Asistente IIBIO-CONICET-UNSAM
Dra. Daniela Castillo, Inv. Adjunta IIBIO-CONICET-UNSAM
Dr. Mauricio Seigelchifer, mAbxience SAU
Dr. Andrés Ciocchini, Chemtest SA
Publicaciones
“A fijivirus major viroplasm protein shows RNA-stimulated ATPase activity by adopting pentameric and hexameric assemblies of dimers”. mBio 14(2):e0002323 (2023). doi: 10.1128/mbio.00023-23.
“A disordered region retains the full protease inhibitor activity and the capacity to induce CD8+ T cells in vivo of the oral vaccine adjuvant U‐Omp19”. Comput. Struct. Biotechnol. J. 20:5098-5114 (2022). doi: 10.1016/j.csbj.2022.08.054.
“Dimer asymmetry and light activation mechanism in Brucella blue-light sensor histidine kinase". mBio, 12(2): e00264-21; DOI: 10.1128/mBio.00264-21 (2021).
“Stability studies of the vaccine adjuvant U-Omp19”. J. Pharm. Sci. 110(2):707-718 (2021). doi: 10.1016/j.xphs.2020.10.011.
“Development of a hyperimmune equine serum therapy for COVID-19 in Argentina”. MEDICINA (Buenos Aires), Vol. 80 (Supl. III): 1-6 (2020). ISSN 1669-910.
“A high-throughput screening for inhibitors of riboflavin synthase identifies novel antimicrobial compounds to treat brucellosis”. FEBS J, 286(13):2522-2535 (2019). doi: 10.1111/febs.14829.
“Physicochemical and biological characterization of RTXM83, a new rituximab biosimilar”. BioDrugs, 33(3):307-319 (2019). doi: 10.1007/s40259-019-00349-2.
“EcXyl43 β-xylosidase: molecular modeling, activity on natural and artificial substrates, and synergism with endoxylanases for lignocellulose deconstruction”. Appl. Microbiol. Biotechnol. 102(16):6959-6971 (2018). doi: 10.1007/s00253-018-9138-7.
“Structural and functional characterization of a cold adapted TPM-domain with ATPase/ADPase activity”. J Struct Biol. 197(3):201–209 (2017). doi: 10.1016/j.jsb.2016.10.010.
“Structural insights into the HWE histidine kinase family: The Brucella blue light-activated histidine kinase domain”. J.Mol.Biol. 428(6):1165-79 (2016).
“Long-lasting immunoprotective and therapeutic effects of a hyperstable E7 oligomer based vaccine in a murine HPV tumor model”. Int. J. Cancer 130(8):1813-20 (2012).
“Development of a second generation prophylactic vaccine against human papilomavirus”. Medicina (B Aires) 71(3):261-266 (2011).
“Specific recognition of a DNA immunogen by its elicited antibody”. J. Mol Biol. 370(1):183-95 (2007).
"Antibody recognition of a flexible epitope at the DNA binding site of the human papillomavirus transcriptional regulator E2”. Biochemistry, 45 (51):15520-15528 (2006).
“A viral DNA-binding domain elicits anti-DNA antibodies of different specificities”. Mol. Immunol 42 (3):327-333 (2005).
“Specific antibody-DNA interaction: a novel strategy for tight DNA recognition”. Biochemistry, 42(20):6218-6227 (2003).
“Antibody response to a viral transcription regulator bound to its target DNA”. FEBSlett. 534(1-3):202-206 (2003).
“Generation of sequence specific, high affinity anti-DNA antibodies”. J. Biol. Chem. 276(16):12769-12773 (2001).
“A synthetic, nitrogenated antimetastatic and anti-angiogenic compound with low toxicity in vivo”. Int. J. Oncol, 14(3):585-591 (1999).
Manuscritos enviados y en preparación
• “Brucella suis ∆mapB outer membrane vesicles as an acellular vaccine against systemic and mucosal virulent B. suis challenge.” Under revision (Vaccines), December 2023.
• “Development of a quantitative sandwich ELISA as a toll for RBD bioprocess optimization”. Acuña Intrieri M.E., Deriane M.A., Rey Serantes, D.A., Czibener C., Goldbaum F.A., Comerci D.J., Cerutti, M.L.
• “A Cellulomonas sp. intracellular GH67 alpha glucuronidase removes terminal glucuronic acid substitutions of xylo-oligosaccharides generated by extracellular GH10 xylanases for C5 sugar utilization”. Mercedes Garrido,M., Ontañon, O., Peña, M., Topalian, J., Navas, L., Guidolín, L.C., Cerutti, M.L. Urbanowicz, B., Campos, E.
Quienes nos apoyan
Agencia Nacional de Promoción de la Investigación, el Desarrollo Tecnológico y la Innovación.
https://www.argentina.gob.ar/ciencia/agencia
Subsecretaria de Ciencia, Tecnología e Innovación del Ministerio de Producción, Ciencia e Innovación Tecnologógica - Gob. de la Prov. de Bs As.
https://www.gba.gob.ar/ciencia/fondo_de_innovacion_tecnologica_de_buenos_aires
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Tecnológicas (CONICET)
https://www.conicet.gov.ar/
Comisión de Investigaciones Científicas (CIC)
https://www.cic.gba.gob.ar/
Consejo Interuniversitario Nacional (CIN)
https://www.cin.edu.ar/
Contacto
Dra. María Laura Cerutti. Linkedin.com/in/maría-laura-cerutti-5b831531
María Eugenia Acuña Intrieri. Linkedin.com/in/maría-eugenia-acuña-intrieri-714670161
